Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ascl1Q02067 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms