Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd1Q01822 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms