Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cacna1cQ01815 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms