Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp1Q01514 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp1Q01514 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms