Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2aQ01320 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms