Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SelpQ01102 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelpQ01102 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms