Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SeleQ00690 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms