Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms