Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gabpb1Q00420 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabpb1Q00420 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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