Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smarcc1P97496 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms