Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms