Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SgcdP82347 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SgcdP82347 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcdP82347 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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