Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx1P81068 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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