Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sparcl1P70663 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms