Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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