Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms