Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cux2P70298 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cux2P70298 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms