Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chl1P70232 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chl1P70232 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms