Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms