Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms