Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms