Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ppfia3P60469 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ppfia3P60469 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms