Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rin3P59729 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms