Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl3P58873 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms