Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Paxbp1P58501 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms