Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Ctdsp1P58466 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp1P58466 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp1P58466 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp1P58466 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp1P58466 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ctdsp1P58466 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms