Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms