Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms