Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SmoP56726 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SmoP56726 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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