Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CckbrP56481 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CckbrP56481 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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