Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtswP56203 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtswP56203 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtswP56203 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtswP56203 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtswP56203 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtswP56203 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtswP56203 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtswP56203 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtswP56203 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms