Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Sh3bp1P55194 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1P55194 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms