Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NcanP55066 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcanP55066 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcanP55066 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcanP55066 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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