Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RabggtbP53612 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RabggtbP53612 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RabggtbP53612 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RabggtbP53612 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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