Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux1P53564 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms