Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec1P51908 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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