Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr5P51682 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms