Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfP51642 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CntfP51642 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntfP51642 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntfP51642 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CntfP51642 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms