Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms