Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms