Protein–RNA interactions for Protein: P49718

Mcm5, DNA replication licensing factor MCM5, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm5P49718 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcm5P49718 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms