Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms