Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Resp18P47939 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Resp18P47939 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Resp18P47939 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms