Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VhlP40338 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms