Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf2P39429 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms