Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspa9P38647 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspa9P38647 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspa9P38647 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hspa9P38647 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hspa9P38647 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hspa9P38647 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hspa9P38647 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hspa9P38647 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms