Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfc1P35601 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfc1P35601 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms