Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PpardP35396 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PpardP35396 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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