Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp4P35123 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp4P35123 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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