Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifnar1P33896 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms